Editing Graph Structure with Cytoscape

Cytoscape でグラフ構造のデータを表現する

 

• Cytoscape Mac版をダウンロード: Download Cytoscape
• このページの説明に従って操作: Cytoscape を使い倒す！〜基本操作編〜 - 統合TV (togotv)(2011-06-03)
  • 今回は有向グラフを作りたいので、Control Panel -> Style を Directed に変更
  • Style -> Properties -> Mapping Type を Discrete Mapping に変更してエッジのラベルを消す
  • 中央のウィンドウにて、Add -> Node でノードを追加
  • ノードを右クリックし、Edit -> Rename node で名前を変更
  • 一通りデータを作ったら、Layouts -> yField Layouts -> Organic などで整形
  • さいごに File -> Export -> Network View as Graphics... などでエクスポート

こんな感じで Scala のスキルマップをグラフ構造で表現することができた。